Molecular technique for detection and identification of Helicobacter pylori in clinical specimens: a comparison with the classical diagnostic method Translated title: Técnica molecular para detecção e identificação de Helicobacter pylori em espécimes clínicas: comparação com o método clássico de diagnóstico

Abstract

ABSTRACT Introduction: Helicobacter pylori is a bacterium found in human epithelial cells of the gastrointestinal tract. Its infection is related to different diseases, such as chronic gastritis, peptic ulcers, gastric lymphoma and adenocarcinoma. The infection by H. pylori is present in more than a half of the world population. Objectives: To detect H. pylori and to compare the diagnostic methods of the rapid urease test (RUT) and polymerase chain reaction (PCR). Materials and methods: The study was conducted between April and July, 2015. For such, three biopsies were collected from each patient. Two were used for PCR and one for RUT. Results: A total of 85 samples were collected from patients undergoing endoscopy, with 56 (65.88%) females and 29 (34.11%) males. From the total samples subjected to RUT, 15 (17.64%) were positive and 70 (82.35%), negative. In PCR for detection of gene 16S ribosomal ribonucleic acid (rRNA) of H. pylori, 66 (77.64%) presented positive results and 19 (22.35%), negative results. For the analysis of the presence of UreA gene in all samples, positive results were found in 70 (82.35%), and negative in 15 (17.64%). According to the results, RUT and the molecular test presented statistical difference. Conclusion: PCR is a useful method in the laboratorial routine to detect the presence of H. pylori in the stomach tissue, due to high sensitivity and specificity, but it requires a more careful analysis and standardization.

Translated abstract

RESUMO Introdução: Helicobacter pylori é uma bactéria encontrada nas células epiteliais do trato gastrointestinal humano. Sua infecção relaciona-se com diferentes patologias, como gastrite crônica, úlcera péptica, linfoma gástrico e adenocarcinoma. A infecção por Helicobacter pylori está presente em mais da metade da população mundial. Objetivos: Detectar a presença de H. pylori e comparar os métodos diagnósticos do teste rápido de urease (TRU) e reação em cadeia da polimerase (PCR). Materiais e métodos: No estudo, realizado entre abril e julho de 2015, três biópsias foram coletadas de cada paciente. Duas foram usadas para realizar PCR e uma, para TRU. Resultados: Oitenta e cinco amostras foram coletadas dos pacientes por meio de endoscopia, sendo 56 (65,88%) mulheres e 29 (34,11%) homens. Do total dos indivíduos sujeitos ao TRU, 15 (17,64%) foram positivos e 70 (82,35%), negativos. Na PCR, na detecção do gene 16S ácido ribonucleico ribossômico (rRNA) de H. pylori, 66 (77,64%) apresentaram resultados positivos e 19 (22,35%), negativos. Para a análise da presença do gene UreA em todas as amostras, resultados positivos foram encontrados em 70 (82,35%) e negativos em 15 (17,64%). De acordo com os resultados, o TRU e o teste molecular apresentaram diferenças estatísticas. Conclusão: A PCR é um método útil na rotina laboratorial para detectar H. pylori em tecido de estômago devido à sua alta sensibilidade e especificidade, mas é necessária maior atenção na análise e na padronização.