Zoonotic potential of Enterocytozoon bieneusi among children in rural communities in Thailand Translated title: Potentiel zoonotique d’ Enterocytozoon bieneusi chez les enfants de communautés rurales en Thaïlande

Abstract

Enterocytozoon bieneusi is a common opportunistic intestinal pathogen worldwide. Genotype distribution of E. bieneusi differs by geography and host immunity. In order to investigate the prevalence, genotype characteristics, and host specificity of E. bieneusi in the community, we conducted a preliminary cross-sectional study among children in Western and Northern Thailand. Seventy-eight (78) and 102 stool samples were collected; the prevalence of E. bieneusi was 3.8% and 2.9% by nested PCR in Western and Northern Thailand, respectively. Three genotypes were identified: Genotype D predominated, followed by EbpC, and then novel genotype ETMK1. The first two genotypes have zoonotic potential. Analysis of the genetic proximity of the E. bieneusi ITS sequences from our study, compared with those published in genetic databases, showed that all positive samples were classified into Group 1, the largest group consisting of various host specificity. The present study demonstrates the possible zoonotic transmission of E. bieneusi in rural communities in Thailand. A large-scale investigation of both human and animal samples, as well as improvements in the available phylogenetic tools, will be required to elucidate transmission routes of E. bieneusi in this area.

Translated abstract

Enterocytozoon bieneusi est un pathogène intestinal opportuniste commun et mondial. La distribution des génotypes d’ E. bieneusi change selon la géographie et l’immunité des hôtes. Pour étudier la prévalence, les caractéristiques des génotypes et la spécificité aux hôtes d’ E. bieneusi dans la communauté, nous avons effectué une étude transversale préliminaire chez des enfants de l’ouest et du nord de la Thaïlande. Soixante-dix-huit (78) et 102 échantillons de selles ont été récoltés. La prévalence d’ E. bieneusi, étudiée par PCR, était de 3,8 % et 2,9 %, respectivement, dans l’ouest et le nord de la Thaïlande. Trois génotypes ont été identifiés : le génotype D prédominait, suivi par EbpC, et par le génotype nouveau ETMK1. Les deux premiers génotypes ont un potentiel zoonotique. L’analyse de la proximité génétique des séquences ITS des E. bieneusi de notre étude, comparées avec celles publiées dans les bases de données, montre que tous les échantillons positifs sont classés dans le Groupe 1, le plus grand groupe, qui inclut des spécificités d’hôtes variées. Cette étude démontre la possible transmission zoonotique d’ E. bieneusi dans les communautés rurales de Thaïlande. Une étude à grande échelle d’échantillons à la fois humains et animaux et des améliorations dans les outils phylogénétiques disponibles seront nécessaires pour élucider les voies de transmission d’ E. bieneusi dans cette zone.