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      Diseño de un método molecular para la detección de Ilex dumosa en yerba mate elaborada utilizando una secuencia específica ubicada en la región ITS2 del DNA ribosómico Translated title: Design of a molecular method for the detection of de Ilex dumosa in manufactured yerba mate using a specific sequence situated in the ITS2 region of the ribosomal dna

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          Abstract

          En la provincia de Misiones predominan dos especies del género Ilex: I. paraguariensis e I. dumosa, pero solo la primera debe ser utilizada para la elaboración del producto yerba mate. I. dumosa es frecuentemente utilizada en mezclas con I. paraguariensis, aunque en cantidades superiores al 1% son consideradas adulterantes. Desde el punto de vista tecnológico es factible diferenciarlas a través del uso de marcadores moleculares como las regiones ITS del DNA ribosómico. El objetivo del trabajo fue diseñar una técnica molecular que permita detectar I. dumosa en paquetes de yerba mate cuando esta se encuentre como adulterante. Para ello se trabajó con hojas frescas, 13 marcas comerciales de yerba mate elaborada y yerba canchada. Para el diseño de los cebadores se utilizaron las regiones ITS de I. dumosa y se estandarizaron las condiciones de amplificación, los resultados fueron chequeandos mediante secuenciación. La sensibilidad del método fue de 93,3% y la especificidad de 100%, con un límite de detección de 1% p/p. La técnica fue validada a través del análisis de muestras comerciales y artificialmente adulteradas, sin encontrarse rastros del contaminante en ninguno de los paquetes comerciales testeados.

          Translated abstract

          In Misiones two species of genus Ilex prevail: I. paraguariensis and I. dumosa, but only the first one should be used to manufacture yerba mate products. I. dumosa is frequently used in mixtures with I. paraguariensis, although amounts above 1% are considered adulterants. From the technological perspective, it is feasible to differentiate them through the use of molecular markers such as ITS regions of ribosomal DNA. The aim of this work was to optimize a molecular technique to detect I. dumosa in yerba mate packages when it could be found as adulterant. Fresh leaves and thirteen trademarks of yerba mate and yerba canchada were used for the experience. For primers design ITS regions of I. dumosa were used and amplification conditions were standardized and products were sequenced. The technique sensitivity and specificity were 93.3% and 100% respectively, with a detection limit of 1% w / w. The technique was validated through the analysis of commercial and artificially adulterated samples and no traces of I. dumosa were detected in all commercial packages tested.

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          Uso de marcadores moleculares en plantas; aplicaciones en frutales del trópico

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            Las curvas ROC y las medidas de detectabilidad para la validación de predictores del rendimiento docente

            Se introducen las conocidas curvas ROC (relative operating characteristic) y sus medidas de detectatibilidad asociadas, para la validación de varios predictores del rendimiento académico. Se hace énfasis en las ventajas de este instrumento sobre otras medidas clásicas conocidas como la sensibilidad y la especificidad, para comparar la efectividad de diferentes variables con fines pronósticos. Se exponen algunos resultados relacionados con el fundamento, la interpretación y las expresiones para el cálculo de las diferentes medidas de detectabilidad y se ilustra la aplicación de estas medidas para mostrar las ventajas del índice académico sobre las pruebas de ortografía en el pronóstico del aprovechamiento docente en la enseñanza médica superior.
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              Is Open Access

              AUTHENTICATION OF COMMERCIAL CHILEAN MOLLUSKS USING RIBOSOMAL INTERNAL TRANSCRIBED SPACER (ITS) AS SPECIE-SPECIFIC DNA MARKER

              Contemporary world food safety standards have emphasized the implementation of efficient food traceability systems, including the correct labeling of products for the authentication of the commercialized species. In this context, Chile has reached an important development in agricultural exportations, reaching near US$ 3.82 billion in 2007. Since the identification based on morphologic and organoleptic characteristics is complex during the elaboration process of aquaculture products, molecular tools need to be developed in order to genetically trace aquaculture products. This study analyzed five species of Chilean commercial mo Husks using molecular DNA markers. From the partial sequences of the ribosomal region ITSl-5.8SrDNA-ITS2, the specific primers for the internal transcribed spacers 1 and 2 (ITS1, ITS2) were designed. These primers in 8 fresh species of mollusks, 5 commercial presentations and 3 processed species, obtaining specie-specific band patterns in all cases for both ITS. Additionally, the primers are shown to be highly specific and of replicable amplification products, independently from the commercial presentation of the studied species. Genetically trace aquaculture products. The presence of fraud for species substitution between canned abalone (Haliotis) and loco (Concholepas) species is discussed.
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                Journal
                recyt
                Revista de Ciencia y Tecnología
                Rev. cienc. tecnol.
                Centro de Investigación y Desarrollo Tecnológico, Facultad de Ciencias Exactas, Química y Naturales, Universidad Nacional de Misiones (Posadas )
                1851-7587
                January 2013
                : 0
                : 19
                : 28-34
                Affiliations
                [1 ] Universidad Nacional de Misiones Argentina
                Article
                S1851-75872013000100005
                9a22348f-3aa8-4122-bcef-396684ab1aaa

                http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

                History
                Product

                SciELO Argentina

                Self URI (journal page): http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_serial&pid=1851-7587&lng=en

                Ilex dumosa,ITS regions,Ribosomal DNA,Molecular detection,Regiones ITS,DNA ribosómico,Detección molecular

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