Estructura de la comunidad bacteriana en diferentes tejidos de Lobatus gigas silvestres (Linnaeus, 1758) de la Reserva de Biosfera Seaflower del Caribe Translated title: Bacterial community structure in different tissues of the wild Lobatus gigas (Linnaeus, 1758) from the Caribbean Seaflower Biosphera Reserve

Abstract

RESUMEN La diversidad microbiana de Lobatus gigas no se ha estudiado a fondo a pesar de que se trata de una especie en peligro de extinción. El conocimiento de la microbiota puede ayudar a mejorar la conservación y el cultivo de esta especie. El objetivo de este estudio fue evaluar las poblaciones bacterianas asociadas con la gónada y en los compartimentos intestinales de L. gigas en peligro de extinción de la Reserva de la Biosfera Seaflower del Caribe, utilizando métodos microbiológicos y herramientas moleculares independientes del cultivo. Se generaron los perfiles genéticos de las poblaciones bacterianas y se utilizó la Electroforesis Gradual de Gradiente de Temperatura (TTGE) para compararlos con el ADN total. Un análisis genético y estadístico de las comunidades bacterianas reveló un bajo nivel de diversidad en el tejido de las gónadas en función del número de bandas detectadas mediante TTGE. Además, se encontraron diferencias estadísticas en la estructura de la comunidad bacteriana entre el intestino anterior y el tejido del intestino posterior de L. gigas. Las afiliaciones filogenéticas dominantes de las bacterias en la gónada, según se determinó usando la secuenciación del gen RNAr 16S, pertenecen a Ralstonia (50%). Se discute la posible participación de este género en la reproducción y desarrollo del caracol. Por otro lado, los filotipos bacterianos del intestino anterior y del intestino posterior incluyeron miembros de las clases Alphaproteobactera (12.5%), Betaproteobacteria (12.5%), Gammaproteobacteria (12.5%), Bacilli (31.25%), Clostridia (6.25%), Actinobacteria (6.25%), Mollicutes (6.25%) y Deinococci (6.25%). Conocer la composición bacteriana de la gónada y del intestino anterior y posterior de L. gigas es el primer paso para explorar el manejo adecuado de esta especie, y proporciona información útil para futuras investigaciones que permitan una mejor comprensión del papel de estas poblaciones bacterianas en la salud y la tasa reproductiva de L. gigas.

Translated abstract

ABSTRACT The microbial diversity of Lobatus gigas has not been thoroughly studied despite of them is a specie endangered. Knowledge of microbiota may help to improve the conservation and cultivation of this species. The objective of this study was to evaluate the bacterial populations associated with the gonad and the gut compartments of the wild endangered L. gigas from the Caribbean Seaflower Biosphere Reserve, using microbiological methods and culture-independent molecular tools. The genetic profiles of the bacterial populations were generated and Temporal Temperature Gradient Electrophoresis (TTGE) was used to compare them with total DNA. A genetic and statistical analysis of the bacterial communities revealed a low level of diversity in gonad tissue based on the number of bands detected using TTGE. In addition, statistical differences in bacterial community structure were found between the foregut and hindgut tissue of L. gigas. The dominant phylogenetic affiliations of the gonad bacteria, as determined using 16S rRNA gene sequencing, belong to Ralstonia (50%). The possible involvement of this genus in the reproduction and development of the conch is discussed. On the other hand, the bacterial phylotypes from foregut and hindgut included members of Alphaproteobactera (12.5%), Betaproteobacteria (12.5%), Gammaproteobacteria (12.5%), Bacilli (31.25%), Clostridia (6.25%), Actinobacteria (6.25%), Mollicutes (6.25%) and Deinococci (6.25%) classes. Knowing the composition of the gonad and foregut and hindgut bacteria of L. gigas is the first step toward exploring the proper management of this species, as well as provides useful information to future researches that allow a better understanding of the role of these bacterial populations in the health and reproductive rate of L. gigas.