Morphological and molecular identification with frequency analysis of Calicophoron microbothrioides in central Chile Translated title: Identificação morfológica e molecular com análise de frequência de Calicophoron microbothrioides na região central do Chile

Abstract

Abstract This research aimed to determine the presence of paramphistomids in cattle slaughtered in a slaughterhouse of the Ñuble Region of Chile, to identify flukes and to analyze the frequency of these parasites in the Maule, Ñuble, and Biobío administrative regions of Chile. Between October of 2016 and April of 2017, rumens of 494 cattle were examined for flukes in the forestomachs. Worms were identified morphologically and, in addition, molecular analysis of the internal transcriber spacer region 2 of the fluke’s DNA was done and phylogenetic analyses were performed with Bayesian inference in 14 worms. The frequency was analyzed by locality (low- or highlands) and age. The overall frequency was 11.24%. The district with the highest frequency of presentation was Chillán Viejo (30.8%). Districts in the lowlands had similar frequencies to those in the mountain lands (p=0.1). The frequency of flukes was significantly higher in adult animals than in young ones (p<0.01). We obtained a 460 bp-length fragment of DNA that was identical to the sequences previously identified as Paramphistomum cervi and Calicophoron microbothrioides, and performed morphological analyses confirmed that our samples belonged to C. microbothrioides. This is the first published study of C. microbothrioides in Chile.

Translated abstract

Resumo Este trabalho teve como objetivo determinar a presença de paramphistomídeos em bovinos abatidos em um matadouro da Região do Ñuble do Chile, para identificar parasitas e analisar a frequência desses parasitos nas regiões administrativas de Maule, Ñuble e Biobío, no Chile. Entre outubro de 2016 e abril de 2017, rúmens de 494 bovinos foram examinados à procura de vermes no pré-estômago. Os vermes foram identificados morfologicamente e, além disso, a análise molecular da região interna do espaçador do transcritor 2 do DNA e análises filogenéticas foram realizadas com inferência bayesiana em 14 vermes. A frequência foi analisada pela altitude da localidade (baixa ou alta) e idade. A frequência geral foi de 11,24%. O distrito com as maiores frequências de parasitismo foi Chillán Viejo (30,8%). Os distritos das terras baixas tinham frequências semelhantes às encontradas nas terras das montanhas (p=0,17). A frequência foi significativamente maior em animais adultos do que em jovens (p<0.01). Obtivemos um fragmento de DNA de 460 pb que era idêntico às sequências anteriores identificadas como Paramphistomum cervi e Calicophoron microbothrioides, e realizamos análises morfológicas que permitiram confirmar que nossas amostras pertenciam a C. microbothrioides. Este é o primeiro estudo publicado sobre C. microbothrioides no Chile.