Electronic factors favouring the cis conformation in proline peptidic bonds

Abstract

A quantum chemical study based on B3LYP, 6-31+G* computations offered the possibility of comparing three dipeptides containing as a central residue proline, N ethyl alanine and an alanine respectively in their cis and trans conformations. The presence of the electron donating alkyl substituent on the nitrogen atom is an important factor favouring the cis conformation. The stabilisation of the cis conformer is interpreted as being due to electrostatic and induction interactions between the carbonyl group and the substituent on the nitrogen atom.

Translated abstract

Un estudio químico cuántico basado en cálculos computacionales B3LYP, 6.31+G* permitió la comparación de tres dipéptidos que contienen como residuo central prolina, N etil alanina y alanina, respectivamente, en sus conformaciones cis y trans. La presencia de un sustituyente alquilo donador de electrones sobre el átomo de nitrógeno es un factor importante que favorece la conformación cis. La estabilización del confórmero cis es debida a interacciones electrostáticas y de inducción entre el grupo carbonilo y el sustituyente sobre el átomo de nitrógeno.