The philosophy of total evidence and its relevance for phylogenetic inference

Abstract

The test of congruence under total evidence as used in systematics has been tied to a Popperian philosophy of science, but is here shown to be related to the coherence theory of truth in metaphysics and thus to coherentism in epistemology. Since the test of congruence is coherentist, the contextual (theoretical) background of initial character conceptualization cannot be ignored as is suggested by some proponents of the total evidence approach. The relative merits of a total evidence approach versus conditional data set partitioning are considered, and whereas both have their merits and drawbacks, either approach requires causal grounding of character statements (statements of homology), at least approximately and defeasibly. The conclusion is that character congruence is a necessary, but not also a sufficient, condition for phylogeny reconstruction.

Translated abstract

O teste de congruência baseado em evidência total, como é usado na sistemática, foi atrelado à filosofia Popperiana de ciência, mas aqui se demonstra estar relacionado à teoria coerentista da verdade na metafísica e a teoria do coerentismo na epistemologia. Como o teste de congruência é coerentista, a base contextual (teórica) da conceitualização inicial de caracteres não pode ser ignorada como sugerido por alguns proponentes da abordagem de evidência total. Os méritos relativos apresentados pelas abordagens de evidência total e de partição condicional do conjunto de dados são considerados. Apesar das duas abordagens apresentarem seus méritos e desvantagens, ambas necessitam de um embasamento causal para definição dos caracteres (definição de homologia), ao menos de forma aproximada e falseável. A conclusão é que a congruência de caracteres representa uma condição necessária, mas não suficiente para a reconstrução filogenética.