Diversidad genética al interior de los núcleos reproductivos de las razas pesadas del Plan Nacional de Fomento Equino basado en el análisis de loci microsatélites Translated title: Genetic diversity analysis in the reproductive nuclei of heavy breeds of the National Equine Promotion Plan by using microsatellite loci

Abstract

El Plan Nacional de Fomento Equino para la Agricultura (PNFE) tiene el propósito de generar caballos chilenos de tiro por medio de cruzamientos absorbentes de hembras mestizas criollas con sementales finos de tiro pesado pertenecientes al Ejército de Chile. El objetivo de este estudio fue caracterizar, mediante uso de ADN microsatélites, la variabilidad genética al interior de los núcleos reproductivos finos de las razas Ardenés, Bretón de Montaña y Percherón. Se analizaron 20, 23 y 20 ejemplares mediante el uso de 16 locus de microsatélites (VHL20, HTG4, AHT4, HMS7, HTG6, AHT5, HMS6, ASB23, ASB2, HTG10, HTG7, HMS3, HMS2, ASB17, HMS1 y CA425). El genotipado molecular evidenció que el número total de alelos por locus varió de 1 a 7; 3 a 6 y 2 a 7, con un promedio de 4,3; 4,8; 4,8 alelos por locus para las razas Ardenés, Bretón y Percherón. Además, los valores medios de heterocigosidad observada (Ho) fueron de 0,63; 0,72 y 0,64 para cada raza; en los tres casos el valor medio de la heterocigosidad observada fue mayor que la esperada y que el índice de Nei. El análisis de heterocigosidad e índice de fijación revela que los tres núcleos no presentan déficit de heterocigosidad, indicando un bajo nivel de endogamia.

Translated abstract

In Chile, the National Equine Promotion Plan for Agriculture (PNFE) aims to generate Chilean draft horses through absorbent crosses between native crossbred mares and fine heavy draft stallions belonging to the Chilean Army. The goal of this study was to characterise by microsatellite DNA analysis the genetic variability within the purebred core: Ardenés (20), Bretón (23) and Percheron (20). The individuals were analysed using 16 microsatellite locus (VHL20, HTG4, AHT4, HMS7, HTG6, AHT5, HMS6, ASB23, ASB2, HTG10, HTG7, HMS3, HMS2, ASB17, HMS1 and CA425). Molecular genotyping showed that the total number of alleles for several locus varied from 1 to 7; 3-6 and 2-7, according to each breed, with an average of 4.3; 4.8; 4.8 alleles per locus for the Ardennes, Breton and Percheron, respectively. Mean values of observed heterozygosity (Ho) were 0.63; 0.72 and 0.64 for each race, respectively. In all three cases, the mean observed heterozygosity was higher than expected heterozygosity (He) and Nei index. Heterozygosity and fixation index analysis revealed that the three cores showed a low level of inbreeding.