Detection and genetic characterization of Giardia duodenalis in pigs from large-scale farms in Xinjiang, China Translated title: Détection et caractérisation génétique de Giardia duodenalis chez des porcs de grandes exploitations du Xinjiang, en Chine

Abstract

To study the presence of Giardia duodenalis in Xinjiang, northwest China, we collected 801 fecal specimens from seven large-scale pig farms and screened them using PCR targeting the SSU rRNA gene. Twenty-one (2.6%) of the specimens from five farms were G. duodenalis-positive, with a significant difference in prevalence among different farms (0–8.7%) ( p < 0.01). Giardia duodenalis prevalence was highest in fattening pigs (5.4%, 7/129), followed by sows (3.2%, 7/222), post-weaning piglets (1.8%, 5/281), and pre-weaning piglets (1.2%, 2/169), but there was no significant difference in prevalence among the age groups ( p > 0.05). Sequence analysis of the SSU rRNA gene revealed that the 21 G. duodenalis strains belonged to three assemblages: A ( n = 2), B ( n = 16), and E ( n = 3). Assemblage B was the predominant assemblage and was widely distributed in all G. duodenalis-positive farms and age groups. All G. duodenalis-positive specimens were further assayed at the β-giardin ( bg), glutamate dehydrogenase ( gdh), and triosephosphate isomerase ( tpi) genes, and two tpi, four gdh, and two bg sequences were identified. These data indicate that pigs may be a zoonotic risk and can potentially spread G. duodenalis infection from animals to humans.

Translated abstract

Afin d’étudier la présence de Giardia duodenalis dans le Xinjiang, dans le nord-ouest de la Chine, nous avons collecté 801 échantillons de selles de sept grandes exploitations porcines et les avons analysés à l’aide d’une PCR ciblant le gène SSU de l’ARNr. Vingt-et-un (2,6 %) des spécimens provenant de cinq exploitations étaient positifs pour G. duodenalis, avec une différence de prévalence significative entre les différentes exploitations (0 % à 8,7 %) ( p < 0,01). La prévalence de Giardia duodenalis était la plus élevée chez les porcs d’engraissement (5,4 %, 7/129), suivie des truies (3,2 %, 7/222), des porcelets en post-sevrage (1,8 %, 5/281) et des porcelets en pré-sevrage (1,2 %, 2/169), mais il n’y avait pas de différence significative dans la prévalence entre les groupes d’âge ( p > 0,05). L’analyse de la séquence du gène SSU de l’ARNr a révélé que les 21 souches de G. duodenalis appartenaient à trois assemblages : A ( n = 2), B ( n = 16) et E ( n = 3). L’assemblage B était l’assemblage prédominant et était largement distribué dans toutes les fermes et groupes d’âge positifs pour G. duodenalis. Tous les échantillons positifs pour G. duodenalis ont ensuite été analysés pour les gènes β-giardine ( bg), glutamate déshydrogénase ( gdh) et triosephosphate isomérase ( tpi), et deux séquences de tpi, quatre de gdh et deux de bg ont été identifiées. Ces données indiquent que les porcs peuvent présenter un risque zoonotique et potentiellement transmettre l’infection à G. duodenalis des animaux à l’homme.